Dalam melaksanakan tugasnya, Seksi Intelijen  menyelenggarakan fungsi :

1. Penyipan   perumusan   kebijaksanaan   teknis   di   bidang  intelijen berupa bimbingan,   pembinaan dan pengamanan teknis;
2. Penyiapan  rencana,   pelaksanaan   dan   penyiapan   bahan pengendalian kegiatan intelijen peyelidikan, pengamanan penggalangan dalam rangka kebijaksanaan penegakan hukum baik  preventif maupun  represif    untuk  menangulangi hambatan, tantangan, politik, ekonomi, keuangan , sosial budaya;
3. Pelaksanaan    kegiatan    produksi    dan    sarana    intelijen, membina dan meningkatkan kemampuan, keterampilan dan integritas  kepribadian  aparat  intelijen yustisial  membina aparat   dan   mengendalikan    kekaryaan di lingkungan kejaksaan Negeri yang bersangkutan;
4. Pengamanan teknis terhadap pelaksanaan tugas satuan kerja bidang  personil,   kegiatan   materiil, pemberitaan dan dokumen dengan memperhatikan koordinasi kerjasama dengan instansi pemerintah dan  organisasi lain di daerah terutama dengan aparat intelijen. 

Subseksi Intelijen terdiri dari:

1. Subseksi Ideologi, Politik, Pertahanan, Keamanan, Sosial, Budaya, dan Kemasyarakatan, Teknologi Informasi, Produksi Intelijen, dan Penerangan Hukum.
2. Subseksi Ekonomi, Keuangan dan Pengamanan Pembangunan Strategis.